Symbole wybrane do etalonu herbu to złota kolumna, symbolizująca starą drogę mińską, przy której położone jest miasteczko Rukojnie, oraz kręta srebrna wstążka, symbolizująca pochodzenie nazwy Rukojnie (uważa się, że nazwa Rukojnie pochodzi od nazwy strumienia przepływającego przez wieś – Rukainė).
W heraldyce srebro oznacza wodę, czystość, cnotę i lojalność. Złoto symbolizuje światło oraz bogactwo duchowe. Kolor czerwony oznacza krew, miłość, poświęcenie, odwagę i męstwo, które zostały przelane za państwo litewskie (w Rukojniach aresztowano bohatera powstania polsko-litewskiego 1830-1831 Szymona Konarskiego). Kolor niebieski symbolizuje duchowość, wiarę i dążenie mieszkańców Rukojń do nauki. W heraldyce niebieski oznacza również wszystko, co wiąże się z niebem, spokojem, mądrością.
Projekt heraldyczny przygotował artysta Rolandas Rimkūnas.
Zatwierdzony dekretem Prezydenta Republiki Litewskiej nr 1K-92 z dn. 11 października 2024 r.