Sužionių gyvenvietė istorijos šaltiniuose minima nuo XVI amžiaus. Seniūnijos apylinkės yra išskirtinės gamtos – ežerų, upių ir miškų – apsuptyje. Seniūnijos teritorijoje yra 13 ežerų, Pravalo botaninis draustinis – botaniniu požiūriu itin vertinga Pravalo ežero pakrančių ir pelkėtų vietų augalų bendrijų, retų rūšių augalų vieta. Taip pat Sužionių teritorijoje yra Verdeikių geomorfologinis draustinis. Seniūnija didžiuojasi savo turtinga gamta, todėl Sužionių herbo simbolikoje siūloma naudoti su gamta susijusius elementus. Gamtos simbolika pasakoja apie vietos žmonių rūpestį ateities kartoms išsaugoti švarius miškus, tyras upes ir ežerus.
Herbo projektui pasirinktas simbolis – Paprastasis jūrinis erelis, gyvenantis ir perintis Sužionių apylinkėse, įrašytas į Lietuvos raudonąją knygą. Erelio simbolika heraldikoje reiškia jėgą, aštrų protą, įžvalgumą, kilnumą.
Sužionių herbo etaloną suprojektavo dailininkas Rolandas Rimkūnas.
Patvirtintas 2023 m. rugsėjo 26 d. Lietuvos Respublikos Prezidento dekretu Nr. 1K-1454